小东营清真寺位于广东省广州市小东营街，修建于明代成化年间，当时回族官兵来粤驻守屯田，为了宗教生活方便始建清真寺。他们在营地附近建造了东营、濠畔、南胜3座清真寺，与唐初所建之怀圣寺四“坊”并立，形成广州伊斯兰教多元发展的新格局。2004年广州市伊协九届委员会新立的《东营寺重修碑记》记载了这段历史。

　　清代，东营寺多次重修，及至民国，又在寺内兴教办学。寺内现存有很多文物，如明朝时刻的阿拉伯文巨匾、《至圣百字赞》古匾、《四清真寺公设碑》等古碑，还有民国初年马英萃题赠的木刻楹联。东营寺有爱国爱民、民主管理和接受新事物的优良传统。“五四”运动时，该寺有一批回族青年如何敏衡、何德雄、刘东甫、陈焕文、马正甫、马志超和刘方如等，在开明阿訇杨瑞生的支持下，以该寺为基地，广泛联系进步青年，组织各种活动，传播新文化，改革旧礼教，并先后成立了广东回教同益会、广州回教青年会，出版了《穆民》月刊，改革了义学堂的教育制度，为培养新一代的回族青年起了承先启后的作用，在海内外产生过深远的影响。抗日战争爆发后，广州沦陷，阿訇乡老们不愿当日伪顺民，纷纷离开广州，奔赴内地或港澳，参加抗日救亡宣传活动，直到抗日战争结束，才回来重建家园。 

　　2004年，广州市伊协自筹资金30多万元，对东营寺再次进行大修。这次大修，从门楼到大殿，都修饰一新，寺内地面全部铺砌花岗石，对寺内所有碑铭和匾联修旧如旧，扩建男女浴室和客厅，并在客厅上加盖了一层会议室，新刻了《重修东营寺碑记》，使古寺旧貌换新颜 。